醫療器械許可證備案的辦理流程如下：

1. 準備相關材料：包括企業營業執照副本復印件、企業負責人、質量管理人員的學歷、職稱證明復印件等。

2. 提交備案申請：將相關材料提交至所在地省、自治區、直轄市藥品監督管理部門。

3. 材料審查：藥品監督管理部門對提交的材料進行審查，如材料不全或不符合要求，將要求企業在規定時間內補正。

4. 審批：藥品監督管理部門對符合要求的企業進行審批，頒發醫療器械許可證備案憑證。

5. 取得備案憑證：企業取得醫療器械許可證備案憑證后，可在備案憑證規定的范圍內經營醫療器械。

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